三石神社のある和田岬は、神功皇后じんぐうこうごうが3つの石を立てて占いをして、廣田、生田、長田、住吉の神々をまつることとなったという伝説の地です。その縁から行基ぎょうきがこの地を訪れた際に祠ほこらを立てました。その後、何度かの遷座せんざを経て今にいたっています。